Os casos suspeitos de infecções por Chikungunya são confirmados através do diagnóstico laboratorial positivo para IgM anti-chikungunya ou por um aumento de título de 4 vezes de IgG específico em duas amostras, ou alternativamente, por um resultado positivo de PCR. Uma vez que os anticorpos específicos contra o vírus Chikungunya (IgG, IgM) são detectáveis nos primeiros 6-8 dias após o aparecimento dos primeiros sintomas, a detecção por PCR é essencial para o diagnóstico de infecções agudas. Para a triagem, a detecção de antígenos virais ou anticorpos IgM específicos do vírus é de grande significância.